Everestus Akanno, PhD., Généticien, Genesus Inc.

L'objectif de sélection des programmes de sélection de porcs du noyau est d'améliorer les performances des porcs croisés commerciaux. Cependant, ce qui semble être les mêmes caractères (par exemple, le taux de croissance) peut être exprimé différemment au niveau du troupeau commercial et du troupeau central et peut donc ne pas être génétiquement identique en raison de différences de gestion, d'environnement de production, etc.

Par conséquent, les progrès génétiques réalisés dans le noyau peuvent ne pas être directement observés dans le troupeau commercial. Par conséquent, les efforts de recherche actuels sont axés sur l'évaluation de la possibilité d'incorporer des données commerciales dans les programmes d'évaluation génétique du noyau pour prédire les valeurs de reproduction des animaux du noyau pour la performance des croisements (Christensen et al. Genet.Sel. 2015 / s47-98-10.1186-12711). Cela nécessite de collecter des informations généalogiques supplémentaires du noyau jusqu'au porc commercial afin que les relations génétiques entre les porcs commerciaux et les porcs du noyau puissent être suivies.

Les approches traditionnelles de suivi des informations sur les taureaux et les mères aux niveaux multiplicateur et commercial peuvent être coûteuses et nécessitent généralement des troupeaux de recherche commerciale coopérative qui eux-mêmes peuvent ne pas être vraiment représentatifs des troupeaux commerciaux typiques. Une façon de résoudre ce problème consiste à utiliser les informations génomiques sur les animaux croisés et du noyau pour créer une relation génétique combinée à travers les différents niveaux du troupeau. Une question importante pour l'évaluation génomique utilisant ce type de données est de savoir comment définir les relations génétiques au sein et entre les générations de base de plusieurs populations (par exemple, les races pures, les croisements F1 (YL) et les croisements à trois voies (D (YL))).

Que sont les métafondeurs?

Les métafondeurs sont un groupe d'individus, dont les parents sont inconnus, qui sont considérés comme des fondateurs ancestraux dont les animaux les plus âgés peuvent provenir (Legarra et al. Genetics, Vol. 200, 455–468 juin 2015, doi: 10.1534 / genetics.115.177014). Un groupe de métafondeurs est créé sur la base d'une forme de similitude telle que la lignée génétique, le sexe ou l'âge. Ils sont considérés comme étant liés entre eux et leur relation entre eux est dérivée de la relation génomique de tous leurs descendants.

Utilisation de métafondeurs dans l'évaluation génétique

Le projet d'utiliser les données de tous les niveaux de production dans le but de mener une évaluation génétique combinée de race pure et croisée a ouvert la possibilité de développer une relation combinée et complète pour plusieurs populations pédigrées. Là où le pedigree est disponible comme dans le noyau, chaque race contributrice a ses propres animaux les plus anciens, et ils sont supposés être sans rapport avec les animaux les plus âgés d'autres populations de race pure.

Dans ce scénario, les métafondeurs sont utilisés pour créer une relation entre tous les animaux les plus anciens de différentes races, reliant ainsi les ensembles de données des différentes races. Les informations génomiques sont utilisées pour estimer ces relations pour les données commerciales croisées et ainsi relier les métafondeurs et toutes les sources de données ensemble.

À titre d'exemple, le tableau 1 montre la configuration de l'arbre généalogique pour 11 porcs de tous les niveaux de production. Trois métafondeurs chacun pour Landrace (AF-L), Yorkshire (AF-Y) et Duroc (AF-D) ont été créés pour connecter les trois races. Les individus 1 à 6 représentent les fondateurs de race pure des races Landrace, Yorkshire et Duroc et sont supposés provenir de chacun des trois métafondateurs. Les individus 7 à 9 représentent tous les porcs de race pure nés et élevés dans le noyau. L'individu 10 représente tous les porcs croisés F1 maternels (LY) au niveau du multiplicateur tandis que l'individu 11 représente le croisement terminal à trois voies (D (LY)) au niveau commercial.

La création d'un pedigree complet de cette manière garantit que toutes les données issues des différents systèmes de production sont liées les unes aux autres et utilisées à des fins d'évaluation génétique. La mise en garde avec cet effort est le coût supplémentaire associé au génotypage des animaux à tous les niveaux de production pour pouvoir établir une bonne et complète relation.

Impact des métafondeurs sur la prédiction de la valeur de reproduction

Outre l'impact évident de la réalisation d'une évaluation génétique à l'aide d'un vaste ensemble de données provenant de tous les niveaux de l'industrie, les premiers résultats de la recherche (Xiang et al. J Anim Sci.2017 avril; 95 (4): 1472-1480. Doi: 10.2527 / jas.2016.1155 ; van Grevenhof et al.J.Anim.Sci. 2019.97: 548–558, doi: 10.1093 / jas / sky433) ont montré:

  1. Amélioration de la précision des valeurs d'élevage et amélioration du taux de gain génétique.
  2. Amélioration du classement des candidats à la sélection.
  3. Diminution de la consanguinité.

L'équipe de recherche et développement Genesus recherche et révise en permanence le système d'évaluation génétique et acquiert actuellement des génotypes et phénotypes de tous les niveaux de production pour mettre en œuvre une évaluation génomique des races croisées pour tous les animaux du noyau. Cet effort permettra à Genesus Inc. de continuer à occuper une position de leader dans l'amélioration du mérite génétique des reproducteurs Genesus afin de répondre aux besoins de tous les clients.

Partagez ça ...
Partager sur LinkedIn
LinkedIn
Partager sur Facebook
Facebook
Tweet à ce sujet sur Twitter
Twitter

Catégorisé dans: ,

Cette publication a été écrite par Genesus