Indici di selezione - Possibilità nell'era genomica
Dott. Dinesh Thekkoot PhD, Genesus Genetics
La selezione è il processo attraverso il quale scegliamo gli animali che diventano genitori della prossima generazione, e lo facciamo sin dall'addomesticamento. La questione importante non è se la selezione sia praticata, ma qual è l'obiettivo della selezione. Nell'odierna industria della carne suina l'obiettivo deve essere massimizzare il profitto. Pertanto, identificare l'animale o gli animali migliori che massimizzano il profitto è la parte fondamentale del processo di selezione
I sistemi di selezione tradizionali richiedono la registrazione dei genitori e il test delle prestazioni di molti maiali per tratti multipli attraverso varie fasi della vita e in più ambienti / luoghi. Questo processo richiede molto tempo e ha grandi implicazioni economiche. Con il recente progresso nelle tecnologie e nei metodi genomici, è ora possibile superare molte di queste restrizioni. Le applicazioni genomiche offrono l'opportunità di raccogliere informazioni / tratti nuovi, più dettagliati e complessi da una più ampia popolazione di suini. Questo, insieme ad altri fattori come una migliore comprensione della biologia animale, lo sviluppo di nuove tecnologie di rilevamento / registrazione, ecc. Ci consente di definire e misurare nuovi tratti e migliorare i tratti correnti usati negli indici di selezione.
Tratti dell'indice corrente che beneficiano maggiormente di queste nuove tecnologie:
Caratteristiche di salute e forma fisica: questa è un'area che ha beneficiato in modo significativo del progresso della genomica e delle tecnologie correlate. Ad esempio, PRRS e PED sono malattie economicamente significative che colpiscono l'industria suina in tutto il mondo. Sebbene le misure di vaccinazione e biosicurezza abbiano svolto un ruolo significativo nel controllo dei focolai di malattia, la variabilità e l'infettività dei ceppi virali hanno ostacolato l'efficacia di questi passaggi. I produttori devono inoltre far fronte a crescenti pressioni da parte dei consumatori e degli organismi di regolamentazione per ridurre l'uso di antibiotici e garantire un migliore benessere degli animali. Questi fattori, insieme all'aumento dei costi associati alla riduzione della produttività e all'aumento del costo del lavoro e dei veterinari, richiedono alle organizzazioni di includere i tratti di salute nell'indice di selezione. I progressi genomici offrono opportunità più efficienti per includere questi tratti negli indici di selezione. Genesus ha iniziato a implementarlo e utilizza un marker SNP (Single Nucleotide Polymorphism) associato alla tolleranza alla malattia PRRS nel processo di selezione.
Caratteristiche della carcassa e della qualità della carne: Genesus si impegna a migliorare la qualità della carcassa e della carne. Dal 1998 Genesus ha condotto un programma settimanale di test sulla qualità della carne e delle carcasse e ha incluso questi tratti nel processo di selezione. Per questo motivo, i suini Genesus continuano a eccellere in carcasse, carne e tratti di qualità alimentare. L'incorporazione della genomica nel programma di selezione ci ha aiutato a migliorare questi tratti in modo più efficiente ed efficace. Ad esempio, le precisioni del valore di allevamento stimato (EBV) sono aumentate in media del 76% per i tratti di qualità della carne (colore, marmorizzazione, pH ecc.) E del 137% per i tratti di carcassa (grasso dorsale della carcassa, lombo di carcassa e peso della carcassa caldo).
Caratteristiche dell'assunzione di mangime: Genesus registra da molti anni l'assunzione di mangime durante l'allattamento di suini e scrofe in crescita e l'ha utilizzata nel programma di selezione. Anche in questo caso l'incorporazione della genomica e delle tecnologie di registrazione automatizzata aumenta la precisione dell'EBV di oltre il 30%, aumentando così il tasso di miglioramento genetico.
Tratti di crescita e riproduttivi: i nostri studi per convalidare l'aumento delle precisioni EBV che incorporano informazioni genomiche hanno dimostrato che, le precisioni medie di previsione per i tratti di crescita (età fino a 120 kg, grasso dorsale e profondità del lombo ecc.) Sono aumentate del 47%, 101% rispettivamente per Yorkshire, Landrace e Durocs. Allo stesso modo, l'uso della genomica ha aumentato le precisioni EBV per i nati totali di oltre il 60% nelle popolazioni sia dello Yorkshire che della Landrace. Questi aumenti di accuratezza si traducono in una migliore risposta genetica e redditività dei clienti Genesus.
Nuove caratteristiche che possono essere aggiunte in futuro:
L'obiettivo del miglioramento genetico deve essere sui suini di razza incrociata allevati in mandrie di produzione commerciale. L'uso della genomica aiuterà ad aggiungere informazioni da animali di razza incrociata in mandrie commerciali alla valutazione di animali di razza in una mandria di nucleo. Attualmente, Genesus sta conducendo un ampio progetto di ricerca in collaborazione con l'Università di Alberta e la Iowa State University per determinare i vantaggi delle tecnologie genomiche per incorporare informazioni commerciali incrociate nel processo di selezione del nucleo. Un recente rapporto tecnico di Genesus sul microbioma intestinale ha delineato un progetto relativo alla resilienza alle malattie dei suini in cui anche il microbioma intestinale è un componente. Se economicamente importanti, questi tratti saranno inclusi nei futuri indici di selezione. Oltre ai tratti coinvolti nella misurazione diretta e indiretta delle prestazioni dei suini, è stata raccolta una nuova serie di dati denominata "dati Omics" da studi di biologia funzionale. Esempi sono le informazioni su quali geni sono espressi in tessuti specifici in diversi stadi di sviluppo, struttura proteica, stato di metilazione, interazione di elementi regolatori, ecc. Tutti questi dati possono essere usati come migliori predittori per identificare un suino migliore e più robusto. Genesus sta tenendo d'occhio queste aree e sta partecipando a molti progetti di ricerca condotti in quest'area in varie università di ricerca in Canada e negli Stati Uniti. Se trovati economici, questi "tratti" saranno inclusi nei programmi di selezione di routine in futuro.
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Questo post è stato scritto da Genesus