Rapporto tecnico Genesus

Big Data

Di Nick Boddicker, Ph.D. genetista

La raccolta e l'interpretazione dei dati è una parte fondamentale di un programma di allevamento genetico suino. Senza dati e la sua interpretazione, il progresso genetico non può essere fatto. Con l'evolversi della tecnologia, emerge la capacità di raccogliere nuovi dati e un'azienda di allevamento di successo capitalizzerà queste nuove tecnologie. Inoltre, con l'evolversi della tecnologia, il costo della tecnologia diminuisce. Ad esempio, il costo per gigabyte di spazio di archiviazione in 1980 era ~ $ 500,000. Oggi quel costo è inferiore a $ 0.03 (https://www.backblaze.com/blog/hard-drive-cost-per-gigabyte/). Si tratta di un enorme risparmio in quanto vengono raccolti sempre più dati.

Nella genetica dei suini, ci sono state ondate di raccolta dei dati. La raccolta di dati di base include peso, numero totale nato, numero nato vivo, numero svezzato, svezzamento nell'intervallo di servizio, numero di tettarelle, ecc. Questi sono tratti che non richiedono una tecnologia sofisticata da raccogliere. Backfat ad ultrasuoni, profondità del lombo e grasso intramuscolare sono ora raccolti grazie ai progressi nella tecnologia a ultrasuoni.

Progressi nella qualità delle carcasse e della carne sono emersi nel corso degli anni, comprese le attrezzature per misurare oggettivamente il pH, la marmorizzazione, il colore e la tenerezza. Tutti questi tratti sono importanti per la qualità del cibo. Genesus ha oltre la carcassa 820,000 e le misurazioni della qualità della carne che sono state raccolte da 1998, e questo numero continua a crescere.

Un altro grande generatore di dati nell'industria suina è l'assunzione e il comportamento individuale dei mangimi. Sono disponibili numerosi sistemi che raccoglieranno ogni evento di assunzione di mangime durante la fase di produzione della finitura. Ad oggi, Genesus ha superato 43 milioni di record individuali di assunzione di mangime durante la finitura. Inoltre, la tecnologia è stata sviluppata per misurare l'assunzione di mangime durante la gestazione o l'allattamento. Genesus raccoglie l'assunzione di mangimi per l'allattamento come tratto componente per l'efficienza della lattazione e attualmente ha oltre 21 milioni di record di assunzione di mangime.

Il generatore di dati più recente e più grande è l'informazione genotipo utilizzata per la selezione genomica. Ogni genotipo di un animale riceve ~ punti dati 55,000. Se gli animali 500 venissero genotipizzati ogni settimana, questo sarebbe superiore a 27 milioni di punti dati ogni settimana, o più di 1.4 miliardi all'anno. I file con così tanti dati non possono essere aperti o elaborati con un software tipico su computer e pertanto la società di allevamento deve sviluppare una programmazione speciale per utilizzare queste informazioni.

I dati sono sempre stati parte integrante di un programma di genetica e la quantità di dati raccolti continua a crescere esponenzialmente. Man mano che la tecnologia si evolve e diventa accessibile, verranno raccolte nuove misurazioni e dati. Ci sono alcune aree che si espanderanno in futuro e genereranno grandi quantità di dati, tra cui l'epigenetica (studio dell'espressione genica ereditabile), la proteomica (studio delle varianti proteiche) e la fenotipizzazione su larga scala. Un esempio di un programma di fenotipizzazione su larga scala sarebbe un piccolo impianto per le orecchie che raccoglie i dati sulla temperatura corporea durante il giorno di un maiale. Questi dati potrebbero essere utilizzati per identificare quando un maiale si è ammalato, o informazioni sul dispendio energetico o rilevamento di calore per la riproduzione. Un altro esempio sono le registrazioni video di maiali in una penna per monitorare l'attività e il comportamento, che possono essere correlati al dispendio energetico e all'efficienza. La maggior parte di noi è consapevole della quantità di spazio di archiviazione che un videoclip 1-minute consuma sui nostri smartphone. Immagina la quantità generata durante le riprese di 24 / 7 con più sistemi di monitoraggio in più farm.

Una società di riproduzione di successo svolgerà un ruolo attivo nel tenere il passo con i progressi della tecnologia e l'utilizzo di nuove tecnologie nei loro programmi di allevamento. Genesus è sempre stato aggressivo nel migliorare il proprio programma di allevamento attraverso l'uso di nuove e avanzate tecnologie per aumentare il miglioramento genetico. Questi investimenti in definitiva avvantaggiano i produttori che utilizzano la genetica Genesus.