Hinzufügen des Kundenwerts mit Genotypinformationen
Nick Boddicker, Ph.D.
Genesus hat eine Reihe von Artikeln über die Bedeutung genomischer Informationen zur Verbesserung des genetischen Gewinns geschrieben. Das liegt daran, dass genomische Informationen die Genauigkeit geschätzter Zuchtwerte (EBVs) erheblich verbessern können, insbesondere bei wenig erblichen Merkmalen (Gesamtzahl geborener Tiere), Merkmalen, die nur am Tierkörper gesammelt werden können (pH, Farbe usw.), geschlechtslimitiert (Wurf Merkmale) oder schwierig / teuer zu messen (Futteraufnahme). Darüber hinaus ist dies der wichtigste Vorteil für die Genomik, weil sie letztlich unseren Kunden zugute kommt.
Genotypinformationen haben zusätzliche Vorteile und Nutzen. Einer verwaltet das Inzuchtniveau in einer Population. Dies ist kein Problem auf der Ebene der Vermehrung oder der Vermarktung, da per Definition Tiere, die mit einer anderen Rasse gekreuzt wurden, Nachkommen hervorbringen, die keine Inzucht haben. Außerdem hält Genesus große reinblütige Populationen aufrecht, die Zunahmen in der Inzucht abschwächen. Nichtsdestoweniger kann Inzucht negative Auswirkungen auf die genetische Verbesserung haben, da sie die genetische Variation verringert, was eine wichtige Kennzahl in der genetischen Verbesserungsgleichung ist.
Gen-Entdeckung, unter Verwendung von genomweiten Assoziationsanalysen, ist ein weiterer Vorteil der Genotypinformation. Bei der Genforschung wird das Genom nach Regionen durchsucht, die signifikante Auswirkungen auf wirtschaftlich wichtige Merkmale haben. Mit der routinemäßigen Genotypisierung von Hunderten von Tieren pro Woche hat Genesus begonnen, Gene für neue Merkmale wie die Laktationseffizienz und die Resilienz der Sau zu identifizieren.
Schließlich kann die Genotypinformation der Entdeckung von tödlichen Mutationen weichen. Letale Mutationen in Genen treten auf, wenn eine bestimmte Kombination von Allelen zum Tod eines Tieres führt, typischerweise bevor es geboren wird. Wenn eine bestimmte Genotypenkombination in einer Population fehlt, könnte diese Region ein Kandidat für eine tödliche Mutation sein. Nehmen wir beispielsweise an, dass Vater und Mutter den Genotyp AB für ein Gen haben. Da die parentalen Allele in einem Gen zufällig den Nachkommen zugeordnet werden, wäre die erwartete Häufigkeit der Genotypen in den Nachkommen 25% AA, 50% AB oder BA und 25% BB. Wenn der BB-Genotyp in den überlebenden Nachkommen fehlt, wäre dieses Gen ein Kandidat für eine tödliche Mutation, dh Tiere mit BB-Genotyp sterben in utero. Es wurde berichtet, dass tödliche Mutationen für eine Verringerung der Gesamtanzahl von 2.97-Schweinen pro Wurf verantwortlich sind (Derks et al., 2017). Fast 3-Schweine weniger pro Wurf haben einen wesentlichen Einfluss auf die Rentabilität eines Produzenten. Die Identifizierung von tödlichen Mutationen erfordert eine große Anzahl von Tieren mit Genotypinformationen. Genesus ist aufgrund dieser Hunderten von Tieren, die jede Woche genotypisiert werden, in der Lage, diese Analysen durchzuführen. Dies geschieht in unserer Duroc-Population und wird auch unsere Landrasse- und Yorkshire-Populationen analysieren.
Genesus führt weiterhin Spitzenforschung zum Vorteil seiner Kunden durch. Dazu gehören die Identifizierung und Integration neuer Technologien in unser Zuchtprogramm sowie die Identifizierung neuer Analysen und Anwendungen für unsere aktuellen Technologien.
References:
Derks et al. Eine systematische Untersuchung zur Identifizierung von letalen rezessiven Variationen in hoch verwalteten Schweinebeständen. BMC Genomimcs 2017.
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Dieser Beitrag wurde von Genesus geschrieben