ビッグデータ
Nick Boddicker著、Ph.D. 遺伝学者
データの収集と解釈は、ブタの遺伝育種プログラムにとって重要な部分です。 データとその解釈がなければ、遺伝的進歩はできない。 技術が進化するにつれて、新しいデータを収集する能力が現れ、成功した繁殖企業はこれらの新技術を活用するでしょう。 さらに、テクノロジが進化するにつれて、テクノロジのコストが下がります。 たとえば、1980のストレージのギガバイトあたりのコストは〜500,000でした。 今日のコストは$ 0.03（https://www.backblaze.com/blog/hard-drive-cost-per-gigabyte/）未満です。 ますます多くのデータが収集されるため、これは莫大なコスト削減になります。ブタの遺伝学では、データ収集の波があります。 基本的なデータ収集には、体重、生まれた総数、生まれた生存数、離乳数、離乳間隔、乳頭数などが含まれます。これらは、高度な技術を必要としない特性です。 超音波技術の進歩により、超音波背脂肪、腰の深さ、および筋肉内脂肪が収集されています。
客観的にpH、大理石、色、および優しさを測定するための装置を含む、死体および肉質の進歩が長年にわたり浮上してきた。 これらの形質はすべて、食生活にとって重要です。 Genesusは、820,000以来収集されている1998屠体および肉質測定値を超えており、この数は増加を続けています。
ブタの産業におけるもう一つの大型データジェネレータは、個々の飼料摂取量と行動です。 生産の成長期には、あらゆる飼料摂取事象を収集する多数のシステムが利用可能である。 今日まで、Genesusは仕上げ中に43個の個々の飼料摂取記録を保持しています。 さらに、妊娠または授乳中の飼料摂取量を測定する技術が開発されている。 ジェノサスは、泌乳効率への成分特性として授乳飼料摂取量を収集し、現在21飼料摂取記録を超えている。
最も最近で最大のデータジェネレータは、ゲノム選択のために使用される遺伝子型情報である。 遺伝子型判定された各動物は、〜55,000データ点を受け取る。 500動物が毎週ジェノタイピングされた場合、これは毎週27百万データポイントを上回り、毎年1.4億を超えるでしょう。 このような多くのデータを持つファイルは、コンピュータ上の典型的なソフトウェアでは開かれたり処理されたりすることができないので、この情報を利用するために育成会社によって特別なプログラミングが開発されなければならない。
データは常に遺伝学プログラムの不可欠な部分であり、収集されるデータの量は指数関数的に増加し続けています。 テクノロジーが進化して手頃な価格になると、新しい測定値とデータが収集されます。 大量のデータを生成する将来的に拡大する領域がいくつかあり、これらにはエピジェネティクス（遺伝的遺伝子発現の研究）、プロテオミクス（タンパク質変異の研究）、および大規模な表現型解析が含まれます。 大規模な表現型プログラムの一例は、豚の一日を通して体温データを収集する小さな耳インプラントであろう。 このデータは、豚が病気になったとき、またはエネルギー消費に関する情報、または繁殖のための熱検出を識別するために使用することができる。 もう1つの例は、エネルギー消費と効率に関連する可能性のある活動と行動をモニターするために、豚のビデオ録画です。 私たちのほとんどは、1分のビデオクリップがスマートフォンで消費するストレージ容量を認識しています。 24 / 7を複数の監視システムで複数のファームに渡って撮影するときに生成される量を想像してみてください。
成功した育種企業は、技術の進歩に追いつき、育種プログラムに新技術を活用するために積極的な役割を果たします。 ジェネシスは、遺伝的改善を増強するための新しく強化された技術を使用して、繁殖プログラムを強化することに常に積極的に取り組んできました。 これらの投資は、最終的にジェネシス遺伝学を使用する生産者にとって有益です。
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この投稿はGenesusによって作成されました