Mga tumpak na hula
Dinesh Thekkoot, PhD
University of Alberta and Genesus Inc.
Ang layunin ng pag-aanak ng hayop ay upang pagbutihin ang genetically populasyon. Sa madaling salita, ang susunod na henerasyon ay dapat na mas mataas kaysa sa kasalukuyang henerasyon. Ang hamon ay upang makilala ang pinakamahusay na mga hayop na maging magulang ng susunod na henerasyon. Upang makilala ang isang hinaharap na magulang kailangan nating malaman ang kanilang totoong halaga ng pag-aanak (genetic) (TBV). Sa totoong buhay imposibleng pagmasdan ang TBV ng isang hayop. Sa gayon gumagamit kami ng isang pagtatantya ng TBV na tinatawag na isang tinantyang halaga ng pag-aanak (EBV). Ang mga magulang ng susunod na henerasyon ay pinili batay sa kanilang mga EBV.
Ang isang mahalagang katanungan ay kung gaano katumpak ang isang pagtatantya ng EBV ng TBV? Ang kawastuhan ng EBV ay tinukoy bilang ugnayan sa pagitan ng totoo at tinatayang mga halaga ng pag-aanak. Ang ugnayan na ito ay nagbibigay ng isang kahulugan kung gaano kalapit ang EBV sa TBV. Ang kawastuhan ng EBV ay maaaring saklaw mula sa 0 (isang hindi tumpak na pagtatantya) hanggang sa 1 (ang EBV ay isang perpektong pagtatantya ng TBV). Mas mataas ang katumpakan ng EBV mas mababa ang peligro na pumili ng mga hayop na may mababang TBV bilang mga magulang. Ang kawastuhan ng EBV ay naiimpluwensyahan din ang nakuha ng genetiko mula sa isang programang pagpipilian. Ang pagkakaroon ng genetiko sa isang programa sa pag-aanak ay proporsyonal sa kawastuhan ng EBV. Kung mas mataas ang katumpakan ng EBV na walang pagbabago sa iba pang mga kadahilanan, mas malaki ang magiging nakuha ng genetiko mula sa pagpili.
Ang genetic gain kada taon ay kinakalkula gamit ang formula
Nasaan ang pakinabang sa genetiko bawat taon, ang tindi ng pagpili, ang katumpakan ng EBV, ay ang additive na pamantayang paglihis ng genetiko ng ugali sa ilalim ng pagpili at ang agwat ng henerasyon na ipinahayag sa mga taon. Sa karamihan ng mga programa sa pag-aanak ng baboy, ang tindi ng pagpili at agwat ng henerasyon ay malapit nang ma-optimize nang walang negatibong epekto sa pagkakaiba-iba ng genetiko. Samakatuwid, para sa anumang karagdagang pagtaas sa kailangan naming ipakilala ang mga pamamaraan na maaaring dagdagan ang kawastuhan ng EBV.
Ang katumpakan ng EBV ay nakasalalay sa maraming mga kadahilanan tulad ng, heritability ng trait, halaga at kalidad ng impormasyon na magagamit sa kandidato at mga kamag-anak ng pagpili, mga relasyon sa genetiko sa lahat ng mga hayop, atbp Sa pangkalahatan, mas mataas ang dami ng impormasyon na magagamit, mas mataas ang magiging katumpakan ng EBV.
Mga katumpakan ng EBV gamit ang iba't ibang mga pamamaraan
- Pinakamahusay na linear unbiased na hula (BLUP) hayop modelo. Ang pamamaraan na ito ay ginagamit sa karamihan ng mga genetic na programa ngayon at gumagamit ng lahat ng magagamit na impormasyon para sa pagkalkula ng mga EBV. Tinatantiya ang EBVs gamit ang phenotypes sa mga kandidatong pagpili at mga kamag-anak kasama ang mga relasyon ng mga ninuno. Kasama ang hula, ang BLUP na mga modelo ng hayop ay sabay-sabay na itinatama ang phenotypes para sa sistematikong epekto sa kapaligiran. Halimbawa, ang pamamaraang ito ay tumutukoy sa mga hayop na may kaugnayan sa genetiko sa iba't ibang mga sakahan habang tinatantya ang mga EBV. Ito ang pinaka-tumpak na paraan para sa predicting EBVs gamit ang parehong mga pedigree at phenotypes.
- Genomic Selection (GS). Ang mga batang hayop na walang sariling phenotype ay magkakaroon ng mababang mga katumpakan ng EBV gamit ang mga pamamaraan ng modelo ng hayop ng BLUP. Depende sa katangian, maaaring tumagal ng isang malaking halaga ng oras upang makakuha ng sariling phenotype o ilang mga hayop ay hindi maaaring makakuha ng sariling phenotype. Halimbawa, ito ay tumatagal ng mga 12 na buwan upang makakuha ng mga impormasyon sa magkalat na gilt at mga hayop na pinili ng mga magulang ay hindi makakakuha ng phenotypes ng kalidad ng bangkay at karne. Samakatuwid ito ay magiging mabuti kung maaari naming taasan ang mga katumpakan ng EBV para sa mga uri ng mga katangian. Ang hula ng genom ay isang kamakailan-lamang na paraan upang matugunan ang isyung ito. Hinuhulaan nito ang mga EBV gamit ang tamang impormasyon ng molecular marker nang hindi nangangailangan ng sariling phenotype. Ang mga pag-aaral ay isinasagawa sa Genesus at sa ibang lugar, upang matantya ang mga katumpakan gamit ang GS. Ipinapakita ng mga resulta na para sa isang malaking bilang ng mga katangian ng mga katangian ng GS ay mas mataas kaysa sa mga pamamaraan ng BLUP batay sa mga phenotype at impormasyon ng tala ng mga ninuno.
- Ang pagsasama ng impormasyon ng genomic, phenotypic at pedigree ay maaaring magresulta sa mas mataas na katumpakan kaysa sa GS. Single Step genomic BLUP (SSBLUP) ay ang paraan na pinagsasama ang tatlong pinagmumulan ng impormasyon. Sa kasalukuyan ang pamamaraang ito ay nagbibigay ng pinakamataas na katumpakan ng EBV para sa mga batang hayop. Ang mga pag-aaral na isinagawa sa Genesus ay nagpakita na ang SSBLUP EBV accuracies ay nasa paligid ng 30-50% na mas mataas kaysa sa BLB na nakabatay sa EBV. Ang isang mas mataas na katumpakan ng hula ay nangangahulugan ng isang mas malaking pagbabago sa genetiko bawat taon.
Mga katumpakan ng EBV at inaasahang pagbabagong genetiko sa pagpili para sa ilang mga katangian na gumagamit ng dalawang magkakaibang pamamaraan
Mga Tampok | Genetic standard deviation | BLUP | SSBLUP | ||
Ganap na kawastuan | Pagbabago ng genetiko / taon* | Ganap na kawastuan | Pagbabago ng genetiko / taon* | ||
Kabuuang ipinanganak | 1.15 | 0.31 | 0.63 | 0.42 | 0.85 |
Maghasik ng taba sa backrowing (mm) | 2.49 | 0.36 | 1.57 | 0.53 | 2.32 |
Maghasik ng bigat ng katawan sa farrowing (kg) | 8.61 | 0.32 | 4.84 | 0.40 | 6.04 |
*Ipagpapalagay ang isang pagpipilian ng proporsyon ng 10% at pagitan ng henerasyon ng 1 na taon para sa lahat ng mga katangian at para sa parehong mga pamamaraan
Tulad ng nakikita sa talahanayan sa itaas ang katumpakan ng EBV at ang nagresultang genetic change kada taon ay nadagdagan sa pagdaragdag ng genomic information (BLUP kumpara sa SSBLUP) para sa lahat ng tatlong katangian. Malinaw na ang epekto ng genomic impormasyon sa genetic na pagbabago sa bawat taon ay makabuluhan. Sa Genesus gumagawa kami ng pinaka-tumpak na EBVs para sa aming mga kandidato sa pagpili. Mahalagang namuhunan kami upang mangolekta ng tumpak at napapanahong impormasyon sa lahat ng mga katangian ng pag-unlad, kahusayan, pagpaparami, bangkay at kalidad ng karne, para sa lahat ng mga hayop sa aming nucleus, multiplier at produksyon ng mga kawan. Ang mataas na kalidad ng data kasama ang genomic na impormasyon ay tumutulong sa amin upang tantyahin ang pinaka-tumpak na EBVs posible, assuring ang pinakamataas na genetic tugon at maximum na kakayahang kumita para sa mga customer ng Genesus.
Nakategorya sa: Tampok na Balita, Global Tech
Ang post na ito ay isinulat ni Genesus