Agregar valor del cliente con información de genotipo
Nick Boddicker, PhD
Genesus ha escrito una serie de artículos sobre la importancia de la información genómica para mejorar la ganancia genética. Esto se debe a que la información genómica puede mejorar en gran medida la precisión de los valores de cría estimados (EBV), particularmente para caracteres poco heredables (número total nacido), rasgos que solo pueden recopilarse en el cadáver (pH, color, etc.), sexo limitado (hojarasca rasgos), o difícil / costoso de medir (consumo de alimento). Además, este es el beneficio más importante para la genómica porque, en última instancia, beneficia a nuestros clientes.
La información del genotipo también tiene beneficios y usos adicionales. Uno está administrando el nivel de endogamia en una población. Esto no es un problema en la multiplicación o en el nivel comercial porque, por definición, los animales cruzaron con una descendencia diferente de la raza que no es endogámica. Además, Genesus mantiene grandes poblaciones de pura raza, lo que mitiga los aumentos en la endogamia. No obstante, la endogamia puede tener un efecto negativo en el mejoramiento genético porque disminuye la variación genética, que es una medida importante en la ecuación de mejora genética.
El descubrimiento de genes, utilizando análisis de asociación amplia del genoma, es otro beneficio de la información del genotipo. El descubrimiento de genes está explorando el genoma de las regiones que tienen efectos significativos sobre los rasgos de importancia económica. Con la genotipificación rutinaria de cientos de animales cada semana, Genesus ha comenzado a identificar genes para rasgos novedosos, como la eficacia de la lactancia de las cerdas y la resistencia a las enfermedades.
Por último, la información del genotipo puede dar paso al descubrimiento de mutaciones letales. Las mutaciones letales en los genes ocurren cuando una combinación específica de alelos resulta en la muerte de un animal, generalmente antes de que nazca. Si una combinación particular de genotipos está ausente de una población, esta región podría ser candidata para una mutación letal. Por ejemplo, supongamos que el padre y la madre son genotipo AB de un gen. Debido a que los alelos parentales en un gen se asignan aleatoriamente a la descendencia, la frecuencia esperada de los genotipos en la descendencia sería 25% AA, 50% AB o BA y 25% BB. Si el genotipo BB está ausente de la descendencia sobreviviente, este gen sería un candidato para una mutación letal, es decir, los animales con genotipo BB morirían en el útero. Se ha informado que las mutaciones letales dan cuenta de una reducción en el número total nacido por cerdos 2.97 por camada (Derks et al., 2017). Casi 3 cerdos menos por camada tiene un impacto significativo en la rentabilidad para un productor. La identificación de mutaciones letales requiere una gran cantidad de animales con información de genotipo. Genesus tiene la capacidad de realizar estos análisis debido a los cientos de animales genotipificados cada semana y lo está haciendo en nuestra población de Duroc y también analizará nuestras poblaciones de Landrace y Yorkshire.
Genesus continúa realizando investigaciones de vanguardia para beneficiar a sus clientes. Esto incluye identificar e incorporar nuevas tecnologías en nuestro programa de mejoramiento, junto con la identificación de nuevos análisis y usos para nuestras tecnologías actuales.
Referencias:
Derks et al. Una encuesta sistemática para identificar la variación recesiva letal en poblaciones porcinas altamente manejadas. BMC Genomimcs 2017.
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Este post fue escrito por Genesus