Big Data
Por Nick Boddicker, Ph.D. Genetista
La recopilación e interpretación de datos es una parte crítica de un programa de mejora genética genética porcina. Sin datos y su interpretación, no se puede hacer progreso genético. A medida que la tecnología evoluciona, surge la capacidad de recopilar nuevos datos, y una compañía de cría exitosa capitalizará estas nuevas tecnologías. Además, a medida que la tecnología evoluciona, el costo de la tecnología disminuye. Por ejemplo, el costo por gigabyte de almacenamiento en 1980 era ~ $ 500,000. Hoy ese costo es inferior a $ 0.03 (https://www.backblaze.com/blog/hard-drive-cost-per-gigabyte/). Este es un gran ahorro de costos a medida que se recopilan más y más datos.En genética porcina, ha habido oleadas de recolección de datos. La recopilación de datos básicos incluye el peso, el número total de nacidos, el número de nacidos vivos, el número destetado, el intervalo entre servicios, el conteo de los pezones, etc. Estos son rasgos que no requieren tecnología sofisticada para recolectar. La grasa dorsal ultrasónica, la profundidad del lomo y la grasa intramuscular ahora se recolectan debido a los avances en la tecnología de ultrasonido.
Los avances en la canal y la calidad de la carne han surgido a lo largo de los años, incluido el equipo para medir objetivamente el pH, el veteado, el color y la ternura. Todos estos rasgos son importantes para la calidad de la comida. Genesus tiene más de 820,000 de canal y medidas de calidad de la carne que se han recogido desde 1998, y este número sigue creciendo.
Otro gran generador de datos en la industria porcina es la ingesta y el comportamiento de alimentación individual. Hay varios sistemas disponibles que recogerán cada evento de consumo de alimento durante la fase de producción de finalización de crecimiento. Hasta la fecha, Genesus tiene más de 43 millones de registros de consumo de alimento individuales durante el acabado. Además, la tecnología se ha desarrollado para medir el consumo de alimento durante la gestación o la lactancia. Genesus recolecta la ingesta de alimento de lactancia como un rasgo componente de la eficiencia de lactancia y actualmente tiene más de 21 millones de registros de consumo de alimento.
El generador de datos más reciente y más grande es la información de genotipo que se utiliza para la selección genómica. Cada genotipo de animal recibe ~ puntos de datos 55,000. Si los animales 500 fueran genotipados todas las semanas, esto superaría los 27 millones de puntos de datos cada semana, o más de 1.4 billones por año. Los archivos con esta cantidad de datos no se pueden abrir o procesar con un software típico en las computadoras, y por lo tanto, la compañía de cría debe desarrollar una programación especial para utilizar esta información.
Los datos siempre han sido una parte integral de un programa de genética y la cantidad de datos recopilados continúa creciendo exponencialmente. A medida que la tecnología evoluciona y se vuelve asequible, se recopilarán nuevas mediciones y datos. Hay algunas áreas que se expandirán en el futuro que generarán grandes cantidades de datos y éstas incluyen epigenética (estudio de la expresión de genes hereditarios), proteómica (estudio de variantes de proteínas) y fenotipado a gran escala. Un ejemplo de un programa de fenotipado a gran escala sería un pequeño implante de oído que recolecta datos de temperatura corporal a lo largo del día de un cerdo. Esta información podría usarse para identificar cuándo un cerdo se enfermó, o información sobre el gasto de energía, o detección de celo para la reproducción. Otro ejemplo son las grabaciones de video de cerdos en un corral para monitorear la actividad y el comportamiento, que pueden estar relacionados con el gasto y la eficiencia energética. La mayoría de nosotros conoce la cantidad de almacenamiento que consume un video clip de 1 en nuestros teléfonos inteligentes. Imagine la cantidad generada al filmar 24 / 7 con múltiples sistemas de monitoreo en varias granjas.
Una empresa de reproducción exitosa desempeñará un papel activo para mantenerse al día con los avances en tecnología y la utilización de nueva tecnología en sus programas de mejoramiento. Genesus siempre ha sido agresivo con la mejora de su programa de mejoramiento mediante el uso de tecnología nueva y mejorada para aumentar la mejora genética. Estas inversiones finalmente benefician a los productores que usan la genética Genesus.
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Este post fue escrito por Genesus