Precisión de la predicción
Dinesh Thekkoot, PhD
Universidad de Alberta y Genesus Inc.
El objetivo de la cría de animales es mejorar genéticamente las poblaciones. En otras palabras, la próxima generación debería ser superior a la generación actual. El desafío es identificar los mejores animales para ser padres de la próxima generación. Para identificar a los futuros padres, necesitamos conocer su verdadero valor genético (genético) (TBV). En la vida real es imposible observar el TBV de un animal. Por lo tanto, usamos una estimación del TBV llamada valor genético estimado (EBV). Los padres de la siguiente generación son seleccionados basándose en sus EBVs.
Una pregunta importante es ¿qué tan precisa es una estimación del EBV del TBV? La precisión del VEB se define como la correlación entre los valores genéticos reales y estimados. Esta correlación da una idea de qué tan cerca está el EBV del TBV. La precisión del EBV puede variar de 0 (una estimación inexacta) a 1 (EBV es una estimación perfecta de TBV). Cuanto mayor sea la precisión del EBV, menor será el riesgo de seleccionar animales con bajo TBV como padres. La precisión del VEB también influye en la ganancia genética de un programa de selección. La ganancia genética en un programa de reproducción es proporcional a la precisión del EBV. Cuanto mayor sea la precisión del VEB sin cambios en otros factores, mayor será la ganancia genética de la selección.
La ganancia genética por año se calcula utilizando la fórmula
Donde es la ganancia genética por año, es la intensidad de la selección, es la precisión del EBV, es la desviación estándar genética aditiva del rasgo bajo selección y es el intervalo generacional expresado en años. En la mayoría de los programas de cría de cerdos, la intensidad de la selección y el intervalo generacional están cerca de optimizarse sin tener un efecto negativo sobre la variación genética. Por lo tanto, para cualquier aumento adicional, necesitamos introducir métodos que puedan aumentar la precisión del EBV.
La exactitud del EBV depende de muchos factores como heredabilidad del rasgo, cantidad y calidad de la información disponible sobre el candidato de selección y sus parientes, relaciones genéticas entre todos los animales, etc. En general, cuanto mayor es la cantidad de información disponible, será la precisión EBV.
Precisiones EBV utilizando diferentes métodos
- Mejor predicción lineal no sesgada (BLUP) modelo animal. Este método se utiliza en la mayoría de los programas genéticos de hoy y utiliza toda la información disponible para calcular EBV. Los EBV se calculan utilizando fenotipos en los candidatos de selección y los familiares junto con las relaciones de pedigrí. Junto con la predicción, los modelos animales de BLUP corrigen simultáneamente los fenotipos para efectos ambientales sistemáticos. Por ejemplo, este método explica los animales genéticamente relacionados en diferentes granjas, mientras que la estimación EBVs. Este es el método más preciso para predecir EBVs utilizando tanto pedigrí como fenotipos.
- Selección Genómica (GS). Los animales jóvenes que no tienen su propio fenotipo tendrán una precisión de EBV baja usando métodos de modelo animal BLUP. Dependiendo del rasgo, puede tomar una cantidad de tiempo considerable para obtener un fenotipo propio o algunos animales nunca pueden obtener un fenotipo propio. Por ejemplo, toma alrededor de 12 meses para conseguir la información de la litera en una cerda joven y los animales seleccionados porque los padres nunca conseguirán fecomas de la calidad de la canal y de la carne. Por lo tanto, sería bueno si podemos aumentar la exactitud EBV para estos tipos de rasgos. La predicción genómica es un método recientemente desarrollado para abordar esta cuestión. Predecir EBVs usando la información molecular del marcador con exactitud sin la necesidad de propio fenotipo. Se han realizado estudios en Genesus y en otros lugares, para estimar las precisiones utilizando GS. Los resultados muestran que para un gran número de rasgos, las precisiones de GS son más altas que las de BLUP basadas en fenotipos e información de pedigrí.
- La combinación de información genómica, fenotípica y pedigrítica puede resultar en precisiones más altas que GS. Genómico único paso BLUP (SSBLUP) es el método que combina estas tres fuentes de información. Actualmente, este método proporciona las máximas precisiones EBV para animales jóvenes. Estudios realizados en Genesus han demostrado que las precisiones de SSBLUP EBV estaban alrededor de 30-50% mayor que EBUVs basados en BLUP. Una mayor precisión de la predicción significa un mayor cambio genético por año.
Exactitud de EBVs y cambio genético esperado en la selección de algunos rasgos usando dos métodos diferentes
Rasgos | Desviación estándar genética | BLUP | SSBLUP | ||
Exactitud | Cambio genético / año* | Exactitud | Cambio genético / año* | ||
Total nacido | 1.15 | 0.31 | 0.63 | 0.42 | 0.85 |
Sembrar grasa de espalda al parir (mm) | 2.49 | 0.36 | 1.57 | 0.53 | 2.32 |
Sembrar el peso corporal al parir (kg) | 8.61 | 0.32 | 4.84 | 0.40 | 6.04 |
*Suponiendo una proporción de selección de 10% y el intervalo de generación de 1 año para todos los rasgos y para ambos métodos
Como puede verse en la tabla anterior, la exactitud del EBV y el cambio genético resultante al año aumentaron añadiendo información genómica (BLUP comparada con SSBLUP) para los tres rasgos. Es evidente que el impacto de la información genómica sobre el cambio genético anual es significativo. En Genesus producimos los EBV más precisos para nuestros candidatos de selección. Hemos invertido mucho para recopilar información exacta y actualizada sobre todos los rasgos de crecimiento, eficiencia, reproducción, carcasa y calidad de la carne, para todos los animales de nuestro núcleo, multiplicadores y productores. Esta información de alta calidad junto con la información genómica nos ayuda a estimar los EBVs más precisos posibles, asegurando la mayor respuesta genética y máxima rentabilidad para los clientes de Genesus.
Categorizado en: NOTICIAS DESTACADAS , Tecnología global
Este post fue escrito por Genesus