Intensité de sélection et amélioration génétique

Dinesh Thekkoot, PhD

Université de l'Alberta et Genesus Inc.

 

 

L'élevage vise à améliorer les populations de bétail en utilisant les différences génétiques entre les individus. L'amélioration génétique est obtenue en sélectionnant des animaux supérieurs en tant que parents, ce qui détermine la valeur génétique de la prochaine génération. Le mécanisme de base qui sous-tend ce processus est d'augmenter la fréquence de la forme favorable des gènes dans la population et d'empêcher les animaux génétiquement inférieurs de passer leurs formes défavorables aux prochaines générations.

L'amélioration génétique par année à partir d'un programme d'élevage dépend de quatre facteurs clés et est calculée comme suit:

 

G est l'amélioration génétique par an, i est l'intensité de la sélection, r  est la précision de la sélection, sg est l'écart type génétique du trait sous sélection et L est l'intervalle de génération exprimé en années.

 

L'importance de la précision de la sélection a été décrite en détail dans un article précédent, qui peut être lu ici. Dans ce rapport, nous discuterons d'un autre facteur - L'intensité de la sélection.

 

Il est fréquent que l'élevage d'animaux sélectionne des animaux au moyen d'une troncature, c'est-à-dire que les individus ne sont sélectionnés comme parents que si leurs valeurs d'indice sont supérieures à une certaine valeur de coupure; le point de troncature. La sélection de la troncature entraîne une différence entre les indices moyens des parents sélectionnés et la moyenne globale de la population, appelée différentiel de sélection (S). La différence de sélection est définie comme la supériorité des parents sélectionnés par rapport à la moyenne de la population.

 

Où  J'ai choisi est l'indice moyen des parents sélectionnés et Je population l'indice moyen de la population. Le différentiel de sélection peut être normalisé en le divisant par un écart type de l'indice (S1). Le différentiel de sélection standardisé s'appelle l'intensité de sélection et est exprimé comme i.

 

 

Les équations ci-dessus montrent que plus le différentiel de sélection est élevé, plus l'amélioration génétique (G) sera élevée. 

 

Considérons une population de porcs ayant une valeur d'indice moyenne de 100 et un écart-type des points d'indice 25. Lors de la sélection de cette population, nous sélectionnons généralement parmi le groupe de cochons choisi qui tombe au-dessus d'une certaine valeur d'indice, disons 130. Dans ce cas, 130 s'appelle le point de troncature. La figure 1 représente la répartition de cette population, où les parents sélectionnés sont indiqués par la région ombrée. L'indice moyen des parents sélectionnés sera 142.2 et le différentiel de sélection dans ce scénario sera 42.2 (142.2 - 100).

 

 

En théorie, un plus grand différentiel de sélection entraînera une amélioration génétique accrue. Par conséquent, pour augmenter le différentiel de sélection, nous devons déplacer le point de troncage vers la droite de la distribution. Il en résulte un différentiel de sélection plus élevé, mais un nombre inférieur d'animaux sélectionnés comme parents. La figure 2 démontre le scénario de déplacement du point de troncage vers 140 à partir de 130 (Figure 1). Ici, la moyenne des parents sélectionnés augmentera à 150.6, mais la proportion d'animaux sélectionnés diminue (indiquée par la région ombrée).

 

 

De l'équation 1, on peut voir que, plus haut la valeur de i, plus l'amélioration génétique sera grande par an. La valeur de i dépend de la proportion d'animaux sélectionnés comme parents. Par exemple, lorsque la proportion choisie est 100, c'est-à-dire si nous sélectionnons toute la population, le différentiel de sélection et l'intensité de sélection seront zéro, et il n'y aura pas d'amélioration génétique. À l'inverse, si nous sélectionnons une très faible proportion, disons 0.01% (sélectionnant 1 sur tous les animaux 10,000), l'intensité de sélection sera 3.9, et l'amélioration génétique sera très importante.

 

En général, pour maximiser l'amélioration génétique, les organismes de reproduction doivent maintenir la proportion de sélection aussi faible que possible. Mais pour les populations de noyaux plus petits, une plus grande intensité de sélection peut entraîner une consanguinité plus élevée et réduit ainsi la variance génétique ou l'écart type. De l'équation 1, on peut voir que l'écart type génétique réduit réduira l'amélioration génétique. Des populations de noyaux plus vastes et bien gérées auront une variation génétique accrue. La meilleure façon d'augmenter l'intensité de sélection sans aucun effet négatif sur l'amélioration génétique est d'augmenter la taille de la population du noyau. Genesus gère le plus grand troupeau de noyaux de race pure enregistrés au monde et cette grande population aide à maintenir une intensité de sélection très élevée dans notre programme de reproduction sans effets néfastes, assurant la plus haute réponse génétique et la rentabilité maximale pour les clients de Genesus.

 

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Cette publication a été écrite par Genesus