Aggiunta del valore del cliente con informazioni Genotype
Nick Boddicker, PhD
Genesus ha scritto una serie di articoli sull'importanza delle informazioni genomiche per migliorare il guadagno genetico. Ciò è dovuto al fatto che l'informazione genomica può migliorare notevolmente l'accuratezza dei valori di allevamento stimati (EBV), in particolare per i tratti poco ereditari (numero totale nato), tratti che possono essere raccolti solo sulla carcassa (pH, colore, ecc.) tratti), o difficile / costoso da misurare (assunzione di mangime). Inoltre, questo è il vantaggio più importante per la genomica perché in definitiva avvantaggia i nostri clienti.
Le informazioni sul genotipo hanno anche vantaggi e usi aggiuntivi. Uno sta gestendo il livello di consanguineità in una popolazione. Questo non è un problema a livello di moltiplicazione o di commercio perché, per definizione, gli animali sono incrociati con una progenie diversa dalla razza che non è in embrione. Inoltre, Genesus mantiene grandi popolazioni di razza, che mitiga l'aumento di consanguineità. Tuttavia, la consanguineità può avere un effetto negativo sul miglioramento genetico perché diminuisce la variazione genetica, che è una metrica importante nell'equazione del miglioramento genetico.
La scoperta genica, utilizzando analisi di associazione genome wide, è un altro vantaggio delle informazioni sui genotipi. La scoperta genetica sta analizzando il genoma per le regioni che hanno effetti significativi su tratti economicamente importanti. Con la genotipizzazione di routine su centinaia di animali ogni settimana, Genesus ha iniziato a identificare i geni per nuovi tratti, come l'efficienza della lattazione della scrofa e la resilienza della malattia.
Infine, le informazioni sul genotipo possono lasciare il passo alla scoperta di mutazioni letali. Mutazioni letali nei geni si verificano quando una specifica combinazione di alleli provoca la morte di un animale, tipicamente prima che nasca. Se una particolare combinazione di genotipi è assente da una popolazione, questa regione potrebbe essere un candidato per una mutazione letale. Ad esempio, supponiamo che il padre e la madre siano genotipi AB per un gene. Poiché gli alleli parentali di un gene sono assegnati in modo casuale alla prole, la frequenza prevista dei genotipi nella progenie sarebbe 25% AA, 50% AB o BA e 25% BB. Se il genotipo BB è assente dalla progenie sopravvissuta, questo gene sarebbe un candidato per una mutazione letale, cioè gli animali con genotipo BB muoiono in utero. Sono state riportate mutazioni letali per giustificare una riduzione del numero totale nato da maiali 2.97 per figliata (Derks et al., 2017). Quasi un maiale 3 in meno per figliata ha un impatto significativo sulla redditività per un produttore. L'identificazione delle mutazioni letali richiede un numero elevato di animali con informazioni sul genotipo. Genesus ha la capacità di fare queste analisi a causa delle centinaia di animali genotipizzati ogni settimana e lo fanno nella nostra popolazione di Duroc e analizzeremo anche le nostre popolazioni di Landrace e Yorkshire.
Genesus continua a fare ricerche all'avanguardia per avvantaggiare i suoi clienti. Ciò include l'identificazione e l'integrazione di nuove tecnologie nel nostro programma di allevamento, oltre all'individuazione di nuove analisi e utilizzi per le nostre attuali tecnologie.
Riferimenti:
Derks et al. Un sondaggio sistematico per identificare la variazione letale recessiva nelle popolazioni di suini altamente gestite. BMC Genomimcs 2017.
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Questo post è stato scritto da Genesus