Big Data
Dr Nick Boddicker, Ph.D. Genetyk
Gromadzenie i interpretacja danych jest kluczową częścią programu hodowli genów trzody chlewnej. Bez danych i ich interpretacji nie można dokonać postępu genetycznego. Wraz z ewolucją technologii pojawia się możliwość gromadzenia nowych danych, a odnosząca sukcesy firma hodowlana wykorzysta te nowe technologie. Co więcej, wraz z rozwojem technologii koszty technologii maleją. Na przykład koszt za gigabajt pamięci w 1980 wynosił ~ $ 500,000. Obecnie koszt ten jest niższy niż $ 0.03 (https://www.backblaze.com/blog/hard-drive-cost-per-gigabyte/). Jest to ogromna oszczędność przy jednoczesnym gromadzeniu coraz większej ilości danych.W genetyce świń odnotowano fale gromadzenia danych. Podstawowe gromadzenie danych obejmuje masę, liczbę urodzeń, liczbę urodzonych żywych, liczbę odstawionych od piersi, odmierzanie do przerwy między serwisem, liczbę sutków itp. Są to cechy, które nie wymagają zaawansowanej technologii do zbierania. Ultradźwiękowe słoniny, głębokość polędwicy i tłuszcz śródmięśniowy są obecnie zbierane ze względu na postęp w technologii ultradźwiękowej.
Postępy w zakresie jakości tusz i jakości mięsa pojawiły się na przestrzeni lat, w tym sprzęt do obiektywnego pomiaru pH, marmurkowania, barwy i tkliwości. Wszystkie te cechy są ważne dla jakości jedzenia. Genesus ma ponad tuszem 820,000 i pomiarów jakości mięsa, które zostały zebrane od 1998, a liczba ta nadal rośnie.
Innym dużym generatorem danych w przemyśle trzody chlewnej jest indywidualne spożycie paszy i zachowanie. Dostępnych jest wiele systemów, które będą zbierać wszystkie zdarzenia związane z przyjmowaniem paszy w fazie wzrostu fazy produkcji. Do tej pory Genesus ma ponad 43 milionów indywidualnych rekordów poboru paszy podczas jego wykończenia. Ponadto opracowano technologię pomiaru spożycia paszy podczas ciąży lub laktacji. Genesus gromadzi paszę z karmienia laktacji jako cechę składową wydajności laktacji i obecnie ma ponad 21 milionów pobranych danych.
Najnowszym i największym generatorem danych jest informacja o genotypie, która jest wykorzystywana do selekcji genomu. Każde genotypowane zwierzę otrzymuje punkty danych 55,000. Jeśli zwierzęta 500 były genotypowane co tydzień, byłoby to ponad 27 milionów punktów danych w każdym tygodniu lub ponad 1.4 miliarda rocznie. Pliki z tak dużą ilością danych nie mogą być otwierane lub przetwarzane przy użyciu typowego oprogramowania na komputerach, dlatego też firma hodowlana musi opracować specjalne oprogramowanie do wykorzystania tych informacji.
Dane zawsze stanowiły integralną część programu genetycznego, a ilość gromadzonych danych nadal rośnie wykładniczo. Gdy technologia ewoluuje i staje się przystępna, gromadzone będą nowe pomiary i dane. Istnieje kilka obszarów, które będą się rozszerzać w przyszłości, które będą generować duże ilości danych i obejmują one epigenetykę (badanie dziedzicznej ekspresji genów), proteomikę (badanie wariantów białek) i fenotypowanie na dużą skalę. Przykładem programu fenotypowania na dużą skalę może być mały implant uszny, który zbiera dane o temperaturze ciała przez cały dzień świni. Dane te można wykorzystać do określenia, kiedy świnia zachorowała, lub informacji na temat wydatków na energię lub wykrycia ciepła w hodowli. Innym przykładem są nagrania wideo świń w piórze w celu monitorowania aktywności i zachowań, które mogą być związane z wydatkami energetycznymi i wydajnością. Większość z nas zdaje sobie sprawę z ilości miejsca, w którym klip wideo 1-minute zużywa się na naszych smartfonach. Wyobraź sobie ilość generowaną podczas filmowania 24 / 7 z wieloma systemami monitorowania w kilku farmach.
Skuteczna firma hodowlana odegra aktywną rolę w dotrzymywaniu kroku postępowi technologicznemu i wykorzystaniu nowych technologii w swoich programach hodowlanych. Genesus zawsze był agresywny w ulepszaniu programu hodowlanego poprzez zastosowanie nowej i ulepszonej technologii w celu poprawy genetycznej poprawy. Te inwestycje przynoszą ostatecznie korzyści producentom, którzy używają genetyki Genesus.
Przeczytaj więcej o naszym programie rozwoju genetycznego i badawczego
Kategorie: Ciekawa Aktualności, Global Tech
Ten wpis został napisany przez Genesusa