ดัชนีการคัดเลือก - ความเป็นไปได้ในยุคจีโนม
ดร. Dinesh Thekkoot PhD, Genesus Genetics
การคัดเลือกเป็นกระบวนการที่เราเลือกสัตว์ที่กลายมาเป็นพ่อแม่ของคนรุ่นต่อไปและเราได้ทำสิ่งนี้มาตั้งแต่การเลี้ยง คำถามสำคัญไม่ได้อยู่ที่การเลือกปฏิบัติ แต่เป้าหมายของการเลือกคืออะไร ในอุตสาหกรรมเนื้อหมูในปัจจุบันเป้าหมายคือการเพิ่มผลกำไรสูงสุด ดังนั้นการระบุสัตว์ที่ดีที่สุดหรือสัตว์ที่สร้างกำไรสูงสุดจึงเป็นส่วนสำคัญของกระบวนการคัดเลือก
ระบบการคัดเลือกแบบดั้งเดิมต้องมีการบันทึกแม่และการทดสอบสมรรถนะของสุกรจำนวนมากสำหรับลักษณะหลายอย่างในช่วงต่างๆของชีวิตและในสภาพแวดล้อม / สถานที่หลายแห่ง กระบวนการนี้ใช้เวลานานและมีนัยสำคัญทางเศรษฐกิจ ด้วยความก้าวหน้าล่าสุดในเทคโนโลยีและวิธีการเกี่ยวกับจีโนมจึงเป็นไปได้ที่จะเอาชนะข้อ จำกัด เหล่านี้ได้ การใช้งานจีโนมทำให้โอกาสในการรวบรวมข้อมูล / ลักษณะใหม่ ๆ ที่ละเอียดและซับซ้อนจากประชากรหมูที่กว้างขึ้น นอกจากนี้ยังมีปัจจัยอื่น ๆ เช่นความเข้าใจที่ดีขึ้นเกี่ยวกับชีววิทยาสัตว์การพัฒนาเทคโนโลยีการตรวจจับ / การบันทึกใหม่เป็นต้นช่วยให้เราสามารถกำหนดและวัดลักษณะใหม่ ๆ และปรับปรุงลักษณะปัจจุบันที่ใช้ในดัชนีการคัดเลือก
ลักษณะดัชนีปัจจุบันที่ได้รับประโยชน์สูงสุดจากเทคโนโลยีใหม่ ๆ เหล่านี้:
ลักษณะสุขภาพและการออกกำลังกาย: เป็นส่วนหนึ่งที่ได้รับประโยชน์อย่างมากจากความก้าวหน้าของจีโนมและเทคโนโลยีที่เกี่ยวข้อง ตัวอย่างเช่น PRRS และ PED เป็นโรคที่มีความสำคัญทางเศรษฐกิจที่ส่งผลกระทบต่ออุตสาหกรรมสุกรทั่วโลก แม้ว่าการฉีดวัคซีนและมาตรการรักษาความปลอดภัยทางชีวภาพมีบทบาทสำคัญในการควบคุมการระบาดของโรค แต่ความแปรปรวนและการติดเชื้อของสายพันธุ์ไวรัสได้ขัดขวางประสิทธิภาพของขั้นตอนเหล่านี้ ผู้ผลิตยังต้องเผชิญกับแรงกดดันที่เพิ่มขึ้นจากผู้บริโภคและหน่วยงานกำกับดูแลเพื่อลดการใช้ยาปฏิชีวนะและให้สวัสดิภาพสัตว์ที่ดีขึ้น ปัจจัยเหล่านี้พร้อมกับต้นทุนที่เพิ่มขึ้นซึ่งเกี่ยวข้องกับผลผลิตที่ลดลงและแรงงานที่เพิ่มขึ้นและต้นทุนด้านสัตวแพทย์ทำให้องค์กรต้องรวมลักษณะสุขภาพไว้ในดัชนีการคัดเลือก ความก้าวหน้าทางพันธุกรรมให้โอกาสที่มีประสิทธิภาพมากขึ้นในการรวมลักษณะเหล่านี้ไว้ในดัชนีการคัดเลือก Genesus ได้เริ่มใช้สิ่งนี้และใช้เครื่องหมาย Single Nucleotide Polymorphism (SNP) ที่เกี่ยวข้องกับความทนทานต่อโรค PRRS ในกระบวนการคัดเลือก
ลักษณะคุณภาพของซากและเนื้อสัตว์: Genesus มุ่งมั่นที่จะปรับปรุงคุณภาพซากและเนื้อสัตว์ ตั้งแต่ปี 1998 Genesus ได้จัดทำโครงการทดสอบคุณภาพซากและเนื้อสัตว์ทุกสัปดาห์และได้รวมคุณลักษณะเหล่านี้ไว้ในกระบวนการคัดเลือก ด้วยเหตุนี้สุกร Genesus จึงมีความโดดเด่นในด้านซากเนื้อสัตว์และคุณภาพการกิน การรวมจีโนมิกส์ในโปรแกรมการคัดเลือกช่วยให้เราสามารถปรับปรุงลักษณะเหล่านี้ได้อย่างมีประสิทธิภาพและประสิทธิผลมากขึ้น ตัวอย่างเช่นค่าความแม่นยำในการผสมพันธุ์โดยประมาณ (EBV) เพิ่มขึ้นโดยเฉลี่ย 76% สำหรับลักษณะคุณภาพของเนื้อสัตว์ (สีหินอ่อนค่า pH ฯลฯ ) และ 137% สำหรับลักษณะซาก (ไขมันส่วนหลังของซากเนื้อซี่โครงและน้ำหนักซากที่ร้อน)
ลักษณะการกินอาหาร: Genesus ได้บันทึกสุกรที่กำลังเติบโตและหว่านการให้นมบุตรเป็นเวลาหลายปีและได้ใช้สิ่งนั้นในโปรแกรมคัดเลือก การผสมผสานจีโนมิกส์และเทคโนโลยีการบันทึกอัตโนมัติอีกครั้งช่วยเพิ่มความแม่นยำของ EBV ได้มากกว่า 30% ซึ่งจะช่วยเพิ่มอัตราการปรับปรุงทางพันธุกรรม
การเจริญเติบโตและลักษณะการสืบพันธุ์: การศึกษาของเราเพื่อตรวจสอบความถูกต้องของ EBV ที่เพิ่มขึ้นโดยใช้ข้อมูลจีโนมแสดงให้เห็นว่าค่าความแม่นยำในการทำนายโดยเฉลี่ยสำหรับลักษณะการเจริญเติบโต (อายุถึง 120 กก. ไขมันส่วนหลังและความลึกของเนื้อซี่โครงเป็นต้น) เพิ่มขึ้น 47%, 101% และ 60% สำหรับ Yorkshire, Landrace และ Durocs ตามลำดับ ในทำนองเดียวกันการใช้จีโนมิกส์ช่วยเพิ่มความแม่นยำของ EBV สำหรับประชากรทั้งหมดที่เกิดมากกว่า 100% ทั้งในยอร์กเชียร์และแลนด์เรซ ความแม่นยำเหล่านี้ช่วยเพิ่มการตอบสนองทางพันธุกรรมและความสามารถในการทำกำไรของลูกค้า Genesus
ลักษณะใหม่ที่สามารถเพิ่มในอนาคต:
จุดเน้นของการปรับปรุงพันธุกรรมต้องอยู่ที่สุกรลูกผสมที่เลี้ยงในฝูงการผลิตเชิงพาณิชย์ การใช้จีโนมิกส์จะช่วยเพิ่มข้อมูลจากสัตว์ผสมข้ามพันธุ์ในฝูงเพื่อการค้าในการประเมินสัตว์สายพันธุ์แท้ในฝูงนิวเคลียส ปัจจุบัน Genesus กำลังดำเนินโครงการวิจัยขนาดใหญ่ร่วมกับ University of Alberta และ Iowa State University เพื่อพิจารณาข้อดีของเทคโนโลยีจีโนมในการผสมผสานข้อมูลลูกผสมเชิงพาณิชย์ในกระบวนการคัดเลือกนิวเคลียส รายงานทางเทคนิคล่าสุดของ Genesus เกี่ยวกับจุลินทรีย์ในกระเพาะอาหารได้กล่าวถึงโครงการที่เกี่ยวข้องกับความยืดหยุ่นของโรคในสุกรซึ่งมีไมโครไบโอมในลำไส้เป็นส่วนประกอบด้วย หากมีความสำคัญทางเศรษฐกิจลักษณะเหล่านี้จะรวมอยู่ในดัชนีการคัดเลือกในอนาคต นอกเหนือจากลักษณะที่เกี่ยวข้องกับการวัดประสิทธิภาพของสุกรทั้งทางตรงและทางอ้อมแล้วยังมีการรวบรวมข้อมูลชุดใหม่ที่เรียกว่า "ข้อมูล Omics" จากการศึกษาชีววิทยาเชิงหน้าที่ ตัวอย่างคือข้อมูลเกี่ยวกับยีนที่แสดงออกในเนื้อเยื่อเฉพาะในขั้นตอนต่างๆของการพัฒนาโครงสร้างโปรตีนสถานะเมธิลการทำงานร่วมกันขององค์ประกอบด้านกฎระเบียบ ฯลฯ ข้อมูลทั้งหมดนี้สามารถใช้เป็นตัวทำนายที่ดีกว่าในการระบุหมูที่ดีและแข็งแรงกว่า Genesus กำลังจับตาดูพื้นที่เหล่านี้อย่างใกล้ชิดและกำลังมีส่วนร่วมในโครงการวิจัยหลายโครงการที่ดำเนินการในพื้นที่นี้ในมหาวิทยาลัยวิจัยต่างๆในแคนาดาและสหรัฐอเมริกา หากพบว่าประหยัด“ ลักษณะ” เหล่านี้จะรวมอยู่ในโปรแกรมการคัดเลือกประจำในอนาคต
จัดหมวดหมู่: ข่าวเด่น, Global Tech
โพสต์นี้เขียนขึ้นโดย Genesus