选择指标 - 基因组时代的可能性
Dinesh Thekkoot博士，Genesus遗传学博士
选择是我们选择成为下一代亲本的动物的过程，自驯化以来我们一直在这样做。 重要的问题不是是否实行选择，而是选择的目的是什么。 在当今的猪肉行业中，目标是使利润最大化。 因此，确定最佳利润的最佳动物是选择过程的关键部分
传统的选择系统需要对不同生命阶段和多个环境/地点的多种性状的许多猪进行亲子记录和性能测试。 这个过程非常耗时且具有很大的经济影响。 随着近期基因组技术和方法的进步，现在可以克服许多这些限制。 基因组应用为从更广泛的猪群中收集新的，更详细和更复杂的信息/特征提供了机会。 这一点以及其他因素，如对动物生物学理解的提高，新感测/记录技术的发展等等，使我们能够定义和衡量新的特征，并增强选择指标中使用的当前特征。
这些新技术最受益于目前的指数特征：
健康和健身特征：这是随着基因组和相关技术的发展而受益的领域。 例如，PRRS和PED是影响全球养猪业的具有重大经济意义的疾病。 尽管疫苗接种和生物安全措施在控制疾病暴发方面发挥了重要作用，但病毒株的变异性和传染性阻碍了这些步骤的有效性。 生产者还面临来自消费者和监管机构的越来越大的压力，以减少抗生素的使用并提供更好的动物福利。 这些因素以及与生产率降低，人工和兽医成本增加相关的成本增加，要求组织在选择指数中包括健康特征。 基因组学的进步提供了更有效的机会，可以将这些特征纳入选择指数。 Genesus已开始实施此方法，并在选择过程中使用与PRRS疾病耐受性相关的单核苷酸多态性（SNP）标记。
体和肉质特征：Genesus致力于改善cas体和肉质。 自1998年以来，Genesus每周进行一次cas体和肉品质测试计划，并将这些特征纳入选择过程。 因此，Genesus的猪在car体，肉和饮食品质方面继续表现出色。 将基因组学纳入选择计划有助于我们以更有效的方式改善这些特征。 例如，肉质性状（颜色，大理石花纹，pH等）的估计育种价值（EBV）准确性平均提高了76％，car体性状（back体背部脂肪，car体腰肉和热car体重量）的平均估计育种价值平均提高了137％。
饲料采食特征：多年以来，Genesus一直在记录生长中的猪和母猪泌乳的采食量，并已在选择程序中使用该采食量。 再次结合基因组学和自动记录技术，EBV准确性提高了30％以上，从而提高了遗传改良率。
生长和生殖特征：我们结合基因组信息验证EBV准确性增加的研究表明，对生长性状（年龄至120公斤，背部脂肪和腰部深度等）的平均预测准确性提高了47％，101％和约克郡，长白和杜洛克人分别占60％。 同样，在约克郡和长白地区，使用基因组学可使出生的EBV准确性提高100％以上。 这些准确性的提高转化为Genesus客户的遗传反应和盈利能力的提高。
未来可以添加的新特征：
遗传改良的重点应放在商业生产畜群中饲养的杂交猪上。 使用基因组学将有助于将来自商业畜群中杂交动物的信息添加到对有核畜群中纯种动物的评估中。 目前，Genesus正在与阿尔伯塔大学和爱荷华州立大学合作进行一项大型研究项目，以确定将商业杂交信息纳入核选择过程的基因组技术的优势。 Genesus最近关于肠道肠道微生物组的技术报告概述了一个与猪疾病适应力有关的项目，肠道微生物组也是其中的一个组成部分。 如果在经济上很重要，这些特征将包括在将来的选择指数中。 除了直接和间接测量猪的生产性能外，还从功能生物学研究中收集了一组称为“ Omics数据”的新数据。 例子是有关哪些基因在不同发育阶段，蛋白质结构，甲基化状态，调节元件的相互作用等方面在特定组织中表达的信息。所有这些数据可以用作鉴定更好，更健壮的猪的更好的预测指标。 Genesus密切关注这些领域，并参与了该领域在加拿大和美国的各种研究型大学中开展的许多研究项目。 如果发现这些“特征”是经济的，将来将在常规选择程序中包括这些特征。
这篇文章是由Genesus写的