Otra herramienta genómica para mejorar el tamaño de la camada
Dr. Chunyan Zhang, Phd, Genetician Genesus Inc.
El tamaño de la camada es un factor muy importante que determina la rentabilidad de la cerda. Una limitación importante para aumentar el tamaño de la camada es la pérdida embrionaria que ocurre durante la semana 2nd 3rd de gestación (Geisert y Schmitt, 2002, J Anim Sci. 80, E54-E65).
Muchos factores pueden contribuir a esta pérdida y una posible causa de mortalidad embrionaria temprana puede ser la existencia de algunos alelos dañinos (diferentes formas de un gen) para genes esenciales que conducen a la muerte fetal poco después de que una mujer quede embarazada. La frecuencia de estos alelos dañinos podría reducirse en una población después de una selección a largo plazo para un tamaño de camada grande, como en las razas maternas. Sin embargo, en razas que no han sido seleccionadas para aumentar el tamaño de la camada (por ejemplo, Duroc), estos alelos dañinos pueden ser ignorados (u ocultos) y con mayor frecuencia en comparación con los de las poblaciones seleccionadas.
Por lo general, estos alelos dañinos hacen que el feto muera cuando están presentes en el estado homocigótico (llamado recesivo, una copia dañina de cada progenitor, por ejemplo, aa). Cuando están presentes en el estado heterocigótico (los alelos heredados de la madre y el padre son diferentes, como Aa), el individuo sobrevive y es fenotípicamente normal. Este animal heterocigoto, conocido como portador, es muy difícil de identificar y, por lo tanto, puede continuar diseminando los alelos dañinos en la población.
La tecnología genómica ahora proporciona un enfoque de última generación para detectar alelos dañinos que se espera que sean relativamente comunes en una población no seleccionada, pero que nunca ocurren en el estado homocigoto recesivo en animales vivos. Este enfoque solo requiere datos de genotipo en individuos fenotípicamente normales (es decir, vivos) para detectar los alelos dañinos a través del análisis estadístico. Este enfoque se usó inicialmente en ganado lechero y detectó alelos asociados con defectos de fertilidad (VanRaden et al., 2011, J Dairy Sci. 94, 6153-6161). Estudios más recientes han comenzado a buscar cerdos y han encontrado algunos alelos asociados con camadas más pequeñas y más lechones nacidos muertos en líneas de represas y / o líneas comerciales (Häggman y Uimari, 2017, J Anim Breed Genet. 134, 129-135; Howard et al. ., 2017, GSE. 49, 57; Derks y otros, 2017, BMC Genomics. 18, 858).
En la base de datos genómica de Genesus, tenemos miles de cerdos con datos de genotipos informativos (60K, 80K, 650K y secuencia amplia) que nos permiten buscar estos alelos potencialmente dañinos relacionados con el tamaño de la camada y estimar aún más sus efectos sobre la fertilidad del verraco a través de nuestro gran conjunto de fenotipos. Nuestro esfuerzo inicial se centró en los verracos Duroc que usaban genotipos 650K SNP. Se encontró que varias regiones del genoma albergan alelos potencialmente dañinos. Como ejemplo, para el SNP más significativo predijimos que debería haber 45 individuos homocigotos recesivos (aa) pero no se observó ninguno. La región que contiene este SNP se asoció significativamente con más fetos momificados (P <0.001).
En comparación con los informes anteriores en cerdos (véase más arriba), las regiones genómicas identificadas parecen ser de alguna raza o específicas de la población, aunque vimos algunas regiones que pueden superponerse con los hallazgos previos.
Estos hallazgos proporcionan información valiosa para aumentar potencialmente el tamaño de la camada en la población Genesus Duroc. Esto llevaría a que no solo se produzcan más cerdos, sino que se mejore la mejora genética a través de una mayor intensidad de selección. Los enfoques para reducir la frecuencia de estos alelos dañinos incluyen la selección genómica y los planes de apareamiento genómicos utilizando el chip SNP personalizado de Genesus.
La implementación de tales hallazgos de investigación contribuirá significativamente al objetivo de Genesus de aumentar el valor y la rentabilidad para los clientes de Genesus.
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Este post fue escrito por Genesus