Big Data
Par Nick Boddicker, Ph.D. Généticien
La collecte et l'interprétation des données constituent un élément essentiel du programme de sélection génétique génétique des porcs. Sans données et son interprétation, le progrès génétique ne peut être fait. Au fur et à mesure que la technologie évolue, la capacité à collecter de nouvelles données apparaît, et une société de sélection performante va capitaliser sur ces nouvelles technologies. De plus, à mesure que la technologie évolue, le coût de la technologie diminue. Par exemple, le coût par gigaoctet de stockage dans 1980 était de ~ $ 500,000. Aujourd'hui, ce coût est inférieur à $ 0.03 (https://www.backblaze.com/blog/hard-drive-cost-per-gigabyte/). C'est une énorme économie de coûts car de plus en plus de données sont collectées.En génétique porcine, il y a eu des vagues de collecte de données. La collecte de données de base comprend le poids, le nombre total de naissances, le nombre de naissances vivantes, le nombre de sevrages, l'intervalle entre le sevrage et le service, le nombre de trayons, etc. Le gras dorsal ultrasonique, la profondeur de la longe et la graisse intramusculaire sont maintenant recueillis en raison des progrès de la technologie des ultrasons.
Des progrès dans la qualité des carcasses et de la viande ont émergé au fil des années, y compris l'équipement pour mesurer objectivement le pH, le persillage, la couleur et la tendreté. Tous ces traits sont importants pour la qualité de la nourriture. Genesus a plus de 820,000 mesures de carcasse et de qualité de la viande qui ont été recueillies depuis 1998, et ce nombre ne cesse de croître.
Un autre grand générateur de données dans l'industrie porcine est la consommation individuelle et le comportement. Il y a un certain nombre de systèmes disponibles qui recueillera chaque événement de prise d'alimentation pendant la phase de finition de croissance de la production. À ce jour, Genesus a plus de 43 millions d'enregistrements d'ingestion d'aliments individuels pendant la finition. En outre, la technologie a été développée pour mesurer la consommation d'aliments pendant la gestation ou l'allaitement. Genesus recueille l'apport alimentaire de lactation comme un trait de composant à l'efficacité de lactation et a actuellement plus de 21 millions de dossiers d'ingestion d'aliments.
Le générateur de données le plus récent et le plus important est l'information de génotype utilisée pour la sélection génomique. Chaque animal génotypé reçoit ~ 55,000 points de données. Si les animaux 500 étaient génotypés chaque semaine, cela représenterait plus de 27 millions de points de données chaque semaine, ou plus de 1.4 milliards par an. Les fichiers avec autant de données ne peuvent pas être ouverts ou traités avec un logiciel typique sur ordinateur, et par conséquent une programmation spéciale doit être développée par l'entreprise d'élevage pour utiliser cette information.
Les données ont toujours fait partie intégrante d'un programme de génétique et la quantité de données recueillies continue de croître de façon exponentielle. À mesure que la technologie évolue et devient abordable, de nouvelles mesures et données seront recueillies. Il y a quelques domaines qui vont se développer à l'avenir et qui vont générer de grandes quantités de données: l'épigénétique (étude de l'expression génique héritable), la protéomique (étude des variants protéiques) et le phénotypage à grande échelle. Un exemple d'un programme de phénotypage à grande échelle serait un petit implant d'oreille qui recueille des données sur la température corporelle tout au long de la journée d'un porc. Ces données pourraient être utilisées pour identifier quand un porc tombe malade, ou des informations sur la dépense énergétique, ou la détection de chaleur pour la reproduction. Un autre exemple est l'enregistrement vidéo de porcs dans un enclos pour surveiller l'activité et le comportement, ce qui peut être lié à la dépense énergétique et à l'efficacité. La plupart d'entre nous sont conscients de la quantité de stockage qu'un clip vidéo 1-minute consomme sur nos téléphones intelligents. Imaginez la quantité générée lors du tournage de 24 / 7 avec plusieurs systèmes de surveillance dans plusieurs fermes.
Une entreprise d'élevage performante jouera un rôle actif dans le suivi des progrès de la technologie et l'utilisation des nouvelles technologies dans leurs programmes d'élevage. Genesus a toujours été agressif avec l'amélioration de leur programme d'élevage grâce à l'utilisation de nouvelles technologies améliorées pour améliorer l'amélioration génétique. Ces investissements profitent finalement aux producteurs qui utilisent la génétique Genesus.
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Catégorisé dans: DERNIÈRES NOUVELLES, Tech mondial
Cette publication a été écrite par Genesus