Dr Chunyan Zhang, généticien Genesus
Le syndrome de reproduction et respiratoire porcin (SRRP) est une maladie qui affecte à la fois la reproduction et la croissance. Il s'agit d'une maladie virale très coûteuse pour les élevages de porcs du monde entier. La vaccination contre le virus du SRRP (PRRSV) a généralement été infructueuse (Lunney et al., Annu. Rev. Anim. Biosci. 2016, 4: 129). Par conséquent, il est très important d’étudier une autre approche pour améliorer la résilience du porc au SDRP.
Les fermes de noyau ont un statut sanitaire élevé, et il est donc impossible de collecter des données sur les effets de l’infection par le virus du SDRP au niveau du noyau, sauf en cas de rupture du SDRP. Ainsi, d'autres approches sont nécessaires et les outils génomiques offrent des opportunités uniques.
À cette fin, Genesus collabore à des projets de recherche sur le SRRP axés sur la génomique. En utilisant des études expérimentales contrôlées, des marqueurs génétiques de la performance du porc (tels que la prise de poids et la charge virale après une infection) ont été détectés en réponse à l’infection par le virus du SDRP. Un marqueur sur le chromosome 4 (WUR abrégé) a eu des effets significatifs sur la réponse du porc au SRRP au début de la phase de croissance (Boddicker et al., Genet. Select. Evol. 2014, 46: 18). Les porcs avec les génotypes de marqueur WUR favorables (BB et AB) avaient une charge virale et un gain de poids significativement plus faibles que ceux du génotype défavorable (AA), ce qui indique que WUR pourrait être utilisé comme marqueur pour sélectionner les porcs afin d'accroître leur résilience au SDRP.
Maintenant, avec les développements rapides de la génomique, nous pouvons identifier et sélectionner des porcs plus résistants au SDRP, ce qui signifie que les porcs sélectionnés ont une meilleure capacité à maintenir la performance à un niveau donné d'infection (Bishop, Front. Genet. 2012, 3: 168) . Avant d'appliquer WUR dans les programmes de sélection et de sélection, nous devons nous assurer que ce marqueur n'a pas d'effets néfastes sur d'autres caractères économiquement importants.
Pour cela, nous avons analysé plus que de nombreux enregistrements de portée 18,000 (> truies 8000) chez des truies Landrace et Yorkshire pures afin de tester les effets de WUR sur les traits de naissance et de sevrage des litières.
- Pour Landrace, les truies avec le génotype AB (favorable) de WUR ont un nombre total similaire: nées, nues vivantes, 24h vivantes et mort-nés par rapport aux truies de génotype AA.
- Pour le Yorkshire, les truies avec le génotype AB se sont comportées de la même manière que les truies avec le génotype AA, à l'exception du nombre vivant à 24h qui était d'environ 0.53 (P <0.08) plus élevé pour les truies AB par rapport aux truies AA.
- Pour les caractères de sevrage de la litière, toutes les truies de génotype AB avaient un poids en sevrage et au sevrage total supérieur, mais non significatif, que les truies de génotype AA.
De plus, nous avons testé les effets WUR dans les caractères de finition de croissance, y compris les jours jusqu'à 120 kg, la profondeur de graisse dorsale par ultrasons et la profondeur de longe ultrasonique ajustée à 120 kg, chez> 14,000 XNUMX porcs de finition.
- À Duroc, Landrace et Yorkshire, des porcs présentant différents génotypes de WUR ont présenté des performances similaires pour tous les caractères, ce qui indique que le WUR n'a aucun effet significatif sur ces caractères de croissance et de finition.
Une étude récente (Dunkelberger et al., J. Anim. Sci. 2017, 95: 2838) a également révélé que l'effet du WUR n'était pas significatif pour presque tous les traits reproductifs de la truie (nombre total de naissances, de mort-nés, de lactation, de et mortalité de la litière). Pour les caractères de croissance de finition (profondeur du gras dorsal, gain quotidien et consommation moyenne quotidienne), l’effet de la WUR n’est pas significatif pour la plupart des traits de croissance, mais l’ampleur et la direction de l’effet sont légèrement différentes selon les traits et les lignes. Ces rapports sont cohérents avec notre analyse.
Par conséquent, le choix du génotype WUR favorable devrait augmenter la résilience du porc au SDRP sans compromettre les performances de reproduction ou de croissance. Genesus utilise plusieurs approches pour augmenter la résilience du porc au SDRP dans notre programme d'élevage et de sélection, notamment:
- Genesus utilise une puce SNP conçue sur mesure (> 55,000 XNUMX marqueurs) qui comprend le SNP WUR pour génotyper les candidats à la sélection peu après la naissance. Les informations WUR sont utilisées pour les décisions de sélection précoce.
- Nous tenons compte du génotype WUR du porc lors de l'accouplement planifié, de manière à pouvoir augmenter la fréquence des génotypes WUR favorables.
- Dans notre programme de sélection, nous incluons le génotype WUR d'un animal dans la décision finale de sélection des jeunes animaux de remplacement du noyau afin d'augmenter le nombre de génotypes favorables dans nos populations.
L’utilisation d’informations génomiques dans les programmes d’accouplement et de sélection permet à Genesus d’accroître la résilience de nos porcs au SDRP et contribue à la réalisation de l’objectif ultime consistant à accroître les profits des clients de Genesus.
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Cette publication a été écrite par Genesus