Ajout de la valeur client avec les informations de génotype
Nick Boddicker, PhD
Genesus a écrit un certain nombre d'articles sur l'importance de l'information génomique pour améliorer le gain génétique. En effet, l'information génomique peut grandement améliorer la précision des valeurs génétiques estimées (EBV), en particulier pour les caractères faiblement héréditaires (nombre total de naissances), les caractères qui ne peuvent être collectés que sur la carcasse (pH, couleur, etc.) traits), ou difficile / coûteux à mesurer (ingestion). De plus, c'est l'avantage le plus important de la génomique, car elle profite finalement à nos clients.
Les informations sur le génotype ont également des avantages et des utilisations supplémentaires. On gère le niveau de consanguinité dans une population. Ce n'est pas un problème au niveau de la multiplication ou du commerce parce que, par définition, les animaux croisés avec une race différente produisent des descendants qui ne sont pas consanguins. En outre, Genesus maintient de grandes populations de race pure, ce qui atténue les augmentations de la consanguinité. Néanmoins, la consanguinité peut avoir un effet négatif sur l'amélioration génétique, car elle diminue la variation génétique, qui est une mesure importante dans l'équation d'amélioration génétique.
La découverte de gènes, en utilisant des analyses d'association à l'échelle du génome, est un autre avantage de l'information de génotype. La découverte de gènes balaye le génome pour les régions qui ont des effets significatifs sur les traits économiquement importants. Avec le génotypage de routine sur des centaines d'animaux chaque semaine, Genesus a commencé à identifier des gènes pour des caractères nouveaux, tels que l'efficacité de la lactation des truies et la résilience des maladies.
Enfin, l'information génotypique peut laisser la place à la découverte de mutations létales. Des mutations létales dans les gènes se produisent lorsqu'une combinaison spécifique d'allèles entraîne la mort d'un animal, généralement avant sa naissance. Si une combinaison de génotypes particulière est absente d'une population, cette région pourrait être candidate à une mutation létale. Par exemple, supposons que le père et la mère sont le génotype AB pour un gène. Parce que les allèles parentaux d'un gène sont attribués au hasard à la progéniture, la fréquence attendue des génotypes dans la descendance serait 25% AA, 50% AB ou BA, et 25% BB. Si le génotype BB est absent de la progéniture survivante, ce gène serait candidat à une mutation létale, c'est-à-dire que les animaux porteurs du génotype BB meurent in utero. Des mutations létales ont été rapportées pour expliquer une réduction du nombre total né par les porcs 2.97 par litière (Derks et al., 2017). Les porcs presque 3 moins par portée ont un impact significatif sur la rentabilité pour un producteur. Identifier les mutations létales nécessite un grand nombre d'animaux avec des informations sur le génotype. Genesus a la capacité de faire ces analyses à cause des centaines d'animaux génotypés chaque semaine et fait cela dans notre population de Duroc et analysera aussi nos populations de Landrace et du Yorkshire.
Genesus continue à faire de la recherche de pointe au profit de ses clients. Cela comprend l'identification et l'intégration de nouvelles technologies dans notre programme de sélection, ainsi que l'identification de nouvelles analyses et utilisations pour nos technologies actuelles.
Références:
Derks et al. Une enquête systématique pour identifier la variation récessive létale dans les populations de porcs hautement gérés. BMC Genomimcs 2017.
Catégorisé dans: DERNIÈRES NOUVELLES, Tech mondial
Cette publication a été écrite par Genesus